Lotte Stagsted
Regulatory roles of 3D chromatin topology in alternative splicing and circular RNA biogenesis
Lotte Stagsted, Afdeling for Molekylærbiologi og Genetik, Aarhus Universitet, har af Âé¶¹Éç modtaget en LF Postdoc forskningsbevilling pÃ¥ 2.620.672 kr.
Om projektet
Lotte Stagsted vil undersøge, hvordan tilpasning i kromatin 3D-topologi som reaktion på ændringer i geners udtryk bidrager til reguleringen af ​​specifikke RNA-processer, såsom biogenesen af ​​cirkulære RNA'er, der er overrepræsenteret i neuroner. Hun vil belyse virkningen af ​​'smeltning' af lange gener på RNA i nerveceller (neuroner).
'Smeltning' er et nyligt opdaget træk ved kromatinregulering i post-mitotiske pattedyrceller, der ofte findes i neuronale gener i forbindelse med topoisomerase-følsomhed, som igen er forbundet med neuroudviklingsmæssige og neurodegenerative lidelser. For at udforske 3D-foldning af lange neuronale gener og kortlægge in situ RNA-behandlings parallelt med genomarkitekturkortlægning fra de samme celler, vil projektet drage fordel af nye teknologier og biologiske systemer, der er unikt tilgængelige i et internationalt samarbejde. Resultaterne vil åbne nye veje til karakterisering af molekylære mekanismer for deregulering af genudtrykket på niveauet af transkription til forskellige output.
